Superarvuti ehitas viiruse

USA teadurid on superarvuti abil loonud hetkelise simulatsiooni viirusest ning seda saavutust peetakse bioloogilise organismi terviku esimeseks sedavõrd täpseks imitatsiooniks, kirjutab Nature. Klaus Schulten ja ta kolleegid Illinoisi ülikoolist ehitasid riikliku superarvutilahenduste keskuse arvutit ja arvutiprogrammi NAMD viimast versiooni kasutades arvutimudeli enesest tillukest RNA-kera kujutavast tubaka mosaiikviirusest. Arvuti tegi kindlaks, kuidas iga viiruse ja teda ümbritseva soolalahuse tilga umbes miljon aatomit mõjutavad ligikaudu 50 miljondiku sekundi vältel peaaegu iga teist aatomit. Tavalisel lauaarvutil kuluks selle ülesande lahendamiseks umbes 35 aastat. Teadusväljaandes Structure tutvustatud uuringust ilmneb, et kuigi viirus on tõepoolest sümmeetriline, pulseerub see aeg-ajalt justkui hingates asümmeetrilisse vormi. Arvutimudel näitab ka, et ilma geneetilise materjalita kukuks viiruse väliskest kokku, mis kinnitab teadlaste arvamust, et paljunedes ehitab viirus kesta geneetilise materjali ümber, mitte ei sisesta geneetilist materjali juba valmis kesta sisse. Viiruseid on arvutimodelleeritud ka varem, ent tehnilistel põhjustel on piirdutud vaid viiruse ühe fragmendiga ja jäädud lootma, et kõik ülejäänud viiruse osad käituvad sarnaselt.